Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPM6BQ13491 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms