Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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