Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX3Q13185 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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