Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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