Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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