Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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