Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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