Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
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