Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL16A1Q07092 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms