Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALD1Q05682 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms