Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3AQ05086 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms