Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms