Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms