Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BDH1Q02338 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms