Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms