Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms