Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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