Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IRX6P78412 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX6P78412 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms