Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABP4P57796 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CABP4P57796 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms