Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms