Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms