Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP6P55212 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms