Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD4P55036 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms