Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms