Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSK3BP49841 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms