Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MDH1P40925 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms