Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms