Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBRP36941 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBRP36941 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms