Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP214P35658 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP214P35658 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP214P35658 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms