Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms