Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms