Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIP1P30622 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms