Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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