Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms