Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms