Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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