Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD247P20963 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD247P20963 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD247P20963 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD247P20963 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms