Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD53P19397 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD53P19397 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms