Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB4P16144 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms