Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms