Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms