Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms