Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYBBP04839 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYBBP04839 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms