Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAP4K4O95819 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms