Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA4O75335 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms