Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNSO60931 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms