Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNCRIPO60506 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms