Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms