Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AIREO43918 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AIREO43918 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AIREO43918 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms