Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD28O15084 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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